基神設有一教牧博士學位課程，五碩士學位課程(神學、道學、聖經研究、基督教聖工碩士、基督教聖工碩士-網路課程)，二文憑課程(基督教研究、教會領袖)，及培育中心證書課程。修讀的學分及完成的年數如下。

本院現設有

一個博士學位課程：

課　程	時　間	學　分
教牧博士	三至六年	40

 
五個碩士學位課程*：

課　程	全時間修讀所需時間	學　分
1. 神學碩士	二年	30
2. 道學碩士	三年	90
3. 聖經研究碩士	二年	60
4. 基督教聖工碩士	二年	60
5. 基督教聖工碩士(網路課程)	三年	60

 
文憑課程*：

課　程	全時間修讀所需時間	學　分
1. 基督教研究文憑	一年	30
2. 教會領袖文憑	一年半	30

 
培育中心證書課程：

課　程	學　分
1.1 僕人領袖證書	17
1.2 僕人領袖（進深）證書	28
2. 家庭事工證書	24
3. 兒童事工證書	24
4. 宣教事工證書	24

*申請碩士學位或文憑課程者，須具學士學位或同等學歷。

 

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